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标题: 8种常用DNA甲基化测序技术,你知道几个? [打印本页]
作者: gfddcx 时间: 2022-6-6 17:58
标题: 8种常用DNA甲基化测序技术,你知道几个?
大家好,这里是专注表观组学十余年,测序方法领跑多组学科研服务的易基因。 关于DNA甲基化测序
随着高通量测序技术的发展,我们能够从全基因组水平来分析5'-甲基胞嘧啶及组蛋白修饰等事件,发现很多基因组学研究发现不了的东西,这就是 "DNA甲基化测序"!且近年来测序成本的不断下降及测序技术的迭代更新,DNA甲基化测序方法可选择性更多了。
那么常用的DNA甲基化测序技术有哪些呢?
易基因提供全面的DNA甲基化研究整体解决方案,适用于不同DNA甲基化研究方向。主要包括:
全基因组DNA甲基化测序(WGBS)
简化基因组甲基化测序(RRBS/dRRBS/XRBS)
高通量单细胞甲基化测序(sc-RBS)
靶基因DNA甲基化测序(Target-BS/LHC-BS/Capture-BS)
精准DNA甲基化/羟甲基化测序(oxBS-seq)
单细胞及微量样本DNA甲基化测序(Micro DNA-BS)
微量cfDNA基因组甲基化测序(cfDNA-BS)
(羟)甲基化DNA免疫沉淀测序((h)MeDIP-seq/5hmC-Seal)
(1) 全基因组重亚硫酸盐甲基化测序(WGBS)
全基因组重亚硫酸盐甲基化测序(WGBS)可以在全基因组范围内精确的检测所有单个胞嘧啶碱基(C碱基)的甲基化水平,是DNA甲基化研究的金标准。WGBS能为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术支持,能广泛应用在个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中,也是各物种甲基化图谱研究的首选方法。
全基因组甲基化测序技术通过T4-DNA连接酶,在超声波打断基因组DNA片段的两端连接接头序列,连接产物通过重亚硫酸盐处理将未甲基化修饰的胞嘧啶C转变为尿嘧啶U,进而通过接头序列介导的 PCR 技术将尿嘧啶U转变为胸腺嘧啶T。
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