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鉴于NGS技术的独特优势,越来越多的临床及病理工作者看到了它的价值。但NGS检测平台的规范和标准化要求很高,阻碍了其在临床应用的进一步推广。
人员方面:NGS检测规范的建设,在人员方面跟普通的实验室不同。由于NGS高通量测序会产生大量基因分析,这就对工作人员提出了生物信息学方面的知识储备要求。对检测报告的签发工作人员来说,除了掌握相应的医学知识以外,同时最好具备分子生物学和临床肿瘤相关的知识。也就是说,医院在考虑建设NGS实验室的时候,在人员设置上除了要看相应的资质,还要考量到他们跟临床的关联,未来需要参与肿瘤患者诊断治疗的讨论。
环境、设备和耗材方面:NGS检测平台除了测序仪器以外,配置的其他不同类型设备都需要定期进行强制性检验并记录。由于NGS方法学的特异性,可以扩展到多基因的使用,在使用这类试剂盒做检测时,需要注意在报告上体现监管部门批准的试剂检测范围和拓展的使用范围。
分析方面:除了跟其他分子实验相同的样本方面要求,更重要的是,要注重核酸提取重复性,以及提取效率、纯度、片断是否满足NGS检测的鉴定。样本在进入NGS检测平台前,建立分析前、分析中、分析后关键环节要注意到与其他分子检测不太一样的地方。比方说,在核酸前处理的环节,对DNA片段的长度有完整性要求,必须做质控鉴定。
结果解读方面:一份好的NGS报告应该包括“体细胞/胚系的变异突变解释、肿瘤突变负荷TMB、微卫星不稳定性MSI、丰度”等关键信息。此外,对于一些意义未明的位点,报告应该有相应的说明和对应的策略。
臻和科技以二代测序技术和生物信息学为核心,积极、主动地探索NGS在临床的应用,不断发挥NGS的技术优势与适用范围,为广大肿瘤患者带来更多福利。着眼于如今的NGS落地困境,臻和科技打造出一整套完善、可靠且有创新性的IVD整体解决方案,包括Genecast Genius G1全自动样品处理系统及Genecast INTEGRO V1.0全自动生信分析一体机等重磅体外诊断产品,全面助力NGS技术在医院的落地。
臻和科技在分子诊断领域也进行了全面的布局,除了基于NGS平台的检测,公司还自主开发了针对DNA、RNA、多重免疫组化、数字病理学的检测和服务。同时,通过license in(授权引进)、收购的方式,把受到多个权威国际诊疗指南推荐的MammaPrint®、Immunoscore®、Tissue of Origin®产品收入囊中,将诊断产品的应用拓展至癌症治疗的全周期。
虽然NGS技术的发展仍然存在诸多挑战,但随着臻和科技等企业积极、主动地探索与布局,不断发掘NGS技术的优势和适用范围,真正把这项技术规范化地使用并临床落地,不难预见,NGS技术的未来非常可期!
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